真菌研究小幫手 影像變化一把抓

(中研院提供/李侑珊整理)
中國時報

真菌於地球上幾乎無所不在,包含酵母、黴菌等微生物以及菇類都屬於真菌,跟人類生活息息相關。自然界中約有超過500萬種不同的真菌,其中大部分為絲狀真菌。

如果你曾經把麵包放到發霉,有天驀然回首,會發現麵包長出一塊一塊的黴菌菌絲,但很難精準描述其生長速度、生長範圍、菌絲長度。由於缺乏有效定量分析方法,儘管絲狀真菌多樣性極高且普遍存在於大自然中,科學家們對於大多數的真菌種類之型態、或其生長的了解十分有限。

中央研究院分子生物研究所助研究員薛雁冰團隊研發「真菌形態追蹤器」,可在單一影像中,計算真菌孢子的數量、量測孢子的形狀大小,更能觀察錯綜複雜的菌絲生長樣貌,例如菌絲總長度、分叉數目、菌落面積等。同時,也能藉由分析縮時影像紀錄觀察真菌菌絲隨著時間所發生的變化;更重要的是,軟體比起利用傳統人工方式計算,可以更快速地收集到準確的量化數據。

這個電腦視覺技術可比較野生型真菌和突變型的真菌,兩者菌株生長情況有何不同?並且可以非常精確的做定量的測量描述。

薛雁冰表示,當團隊發現不同菌株之間,看似有生長差異,但是卻很難用定量的方式來描述時,「真菌形態追蹤器」便能夠提供一個快速的方法,精準分析菌株差異,了解菌絲長度密度、菌絲分枝數量與菌落面積。當有了這些資料,就有機會了解真菌生長如何被基因調控。

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