超級細菌解碼突破！研發新藥露曙光

由靜宜大學、清華大學聯合台大醫院新竹分院團隊、元培科技大學與慈濟大學組成的台灣AB團隊，為了解細菌抗藥的原因，進而能找到治療的方法，歷經3年成功將不動桿菌中的一個流行菌株TYTH-1解碼，今101年9月22日拿到美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心審核號碼，成為AB基因體為全世界的第11 條，亞洲地區的第5條，AB 基因體序列亦已於10月3日全球公開。

▲ 元培科技大學劉明麗教授與其超級細菌TYTH。（圖片／取材自教育部電子報）


TYTH-1 菌株曾經在2008 年於台大醫院新竹分院造成菌血症使病人死亡，為了解答細菌有多重抗生素抗藥性與造成病患死亡的原因，台大分院郭漢岳醫師與林明鋒醫師結合感染控制小組與檢驗科細菌組團隊成員從2005 年開始收集菌株，從臨床資料的收集到細菌身分的鑑定，建立了整套細菌分析的流程。
為了要更進一步分析細菌的特性，在當時仍然是台大醫院的前身-行政院衛生署新竹醫院時代，在資源非常有限的情況下，郭醫師團隊成員於2007年結合了元培科技大學劉明麗教授的團隊來做更進一步的菌源分析。

▲ 元培科技大學劉明麗教授與其超級細菌TYTH。（圖片／取材自教育部電子報）


在元培科技大學劉明麗教授的實驗室裡，劉教授帶領著學生不斷的從菌株的抗藥表現型與抗藥基因型去尋求細菌抗藥的真實原因，所有的研究成果自2009年開始發表在美、日、英等國際性抗藥領域的期刊上，特別是2009年的細菌抗藥領域研究成果更是獲得國際研討會論文大獎。由於細菌的抗藥過程非常的複雜，2009年劉教授請求靜宜大學唐傳義校長的協助，期望藉由生物資訊團隊的協助來解答細菌抗藥的機制。
台灣AB團隊研究的包氏不動桿菌(AB菌)原本是環境中存在的細菌，隨著現在醫學的進步，病患的病情嚴重度跟抵抗力均較過去嚴重，使得這種原本對正常人影響不大的細菌開始感染病患，造成許多醫院中住院的患者發生肺炎、泌尿道感染、傷口感染，甚至菌血症。包氏不動桿菌不論在台灣或是其他地區，已經成為臨床治療上值得重視的問題。
台灣AB團隊這次創了2個紀錄，第1，基因體拼組的完整性，卓越的資訊演譯技術配合生物實驗室的驗證技術，合作無間，使得基因體拼接完整。第2，基因體的註解數量最多，團隊技術已經可以和國際其他的團隊並駕齊驅，可以快速通過美國國家醫學圖書館生物技術資訊中心審核。
台大醫院新竹分院感染科主任醫師郭漢岳表示，有了這條基因體，代表已經擁有了非常完整的技術平台，未來可利用此平台技術，來解開其他的物種的基因密碼之外，同時可以利用這些基因資訊來尋找細菌產生抗藥性的機制，並且進一步找出控制抗藥性菌株傳播的方法，甚至找出能治療疾病的新藥物。